Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAS3

SLC28A3, Solute carrier family 28 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A3Q9HAS3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC28A3Q9HAS3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC28A3Q9HAS3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC28A3Q9HAS3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC28A3Q9HAS3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC28A3Q9HAS3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC28A3Q9HAS3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC28A3Q9HAS3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC28A3Q9HAS3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC28A3Q9HAS3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC28A3Q9HAS3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC28A3Q9HAS3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC28A3Q9HAS3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC28A3Q9HAS3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC28A3Q9HAS3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC28A3Q9HAS3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC28A3Q9HAS3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC28A3Q9HAS3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC28A3Q9HAS3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC28A3Q9HAS3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC28A3Q9HAS3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC28A3Q9HAS3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC28A3Q9HAS3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC28A3Q9HAS3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC28A3Q9HAS3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC28A3Q9HAS3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC28A3Q9HAS3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC28A3Q9HAS3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC28A3Q9HAS3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC28A3Q9HAS3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC28A3Q9HAS3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC28A3Q9HAS3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC28A3Q9HAS3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC28A3Q9HAS3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC28A3Q9HAS3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC28A3Q9HAS3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC28A3Q9HAS3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC28A3Q9HAS3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC28A3Q9HAS3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC28A3Q9HAS3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC28A3Q9HAS3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC28A3Q9HAS3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC28A3Q9HAS3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC28A3Q9HAS3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC28A3Q9HAS3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC28A3Q9HAS3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC28A3Q9HAS3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC28A3Q9HAS3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC28A3Q9HAS3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC28A3Q9HAS3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC28A3Q9HAS3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC28A3Q9HAS3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC28A3Q9HAS3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC28A3Q9HAS3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC28A3Q9HAS3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC28A3Q9HAS3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC28A3Q9HAS3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC28A3Q9HAS3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC28A3Q9HAS3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC28A3Q9HAS3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC28A3Q9HAS3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC28A3Q9HAS3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC28A3Q9HAS3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC28A3Q9HAS3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC28A3Q9HAS3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC28A3Q9HAS3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC28A3Q9HAS3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC28A3Q9HAS3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC28A3Q9HAS3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC28A3Q9HAS3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC28A3Q9HAS3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC28A3Q9HAS3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC28A3Q9HAS3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC28A3Q9HAS3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC28A3Q9HAS3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC28A3Q9HAS3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC28A3Q9HAS3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC28A3Q9HAS3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC28A3Q9HAS3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC28A3Q9HAS3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC28A3Q9HAS3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC28A3Q9HAS3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC28A3Q9HAS3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC28A3Q9HAS3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC28A3Q9HAS3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC28A3Q9HAS3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC28A3Q9HAS3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC28A3Q9HAS3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC28A3Q9HAS3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC28A3Q9HAS3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC28A3Q9HAS3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC28A3Q9HAS3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC28A3Q9HAS3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms