Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAR5

1700001F09Rik, RIKEN cDNA 1700001F09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700001F09RikQ9DAR5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700001F09RikQ9DAR5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700001F09RikQ9DAR5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700001F09RikQ9DAR5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700001F09RikQ9DAR5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700001F09RikQ9DAR5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700001F09RikQ9DAR5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700001F09RikQ9DAR5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
1700001F09RikQ9DAR5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
1700001F09RikQ9DAR5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
1700001F09RikQ9DAR5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700001F09RikQ9DAR5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700001F09RikQ9DAR5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700001F09RikQ9DAR5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700001F09RikQ9DAR5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700001F09RikQ9DAR5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700001F09RikQ9DAR5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700001F09RikQ9DAR5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700001F09RikQ9DAR5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700001F09RikQ9DAR5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700001F09RikQ9DAR5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700001F09RikQ9DAR5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700001F09RikQ9DAR5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700001F09RikQ9DAR5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700001F09RikQ9DAR5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700001F09RikQ9DAR5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700001F09RikQ9DAR5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700001F09RikQ9DAR5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
1700001F09RikQ9DAR5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700001F09RikQ9DAR5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700001F09RikQ9DAR5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700001F09RikQ9DAR5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700001F09RikQ9DAR5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700001F09RikQ9DAR5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700001F09RikQ9DAR5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700001F09RikQ9DAR5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
1700001F09RikQ9DAR5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700001F09RikQ9DAR5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700001F09RikQ9DAR5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700001F09RikQ9DAR5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700001F09RikQ9DAR5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700001F09RikQ9DAR5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700001F09RikQ9DAR5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700001F09RikQ9DAR5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
1700001F09RikQ9DAR5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700001F09RikQ9DAR5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700001F09RikQ9DAR5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
1700001F09RikQ9DAR5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700001F09RikQ9DAR5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700001F09RikQ9DAR5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700001F09RikQ9DAR5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700001F09RikQ9DAR5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700001F09RikQ9DAR5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700001F09RikQ9DAR5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700001F09RikQ9DAR5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700001F09RikQ9DAR5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700001F09RikQ9DAR5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
1700001F09RikQ9DAR5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
1700001F09RikQ9DAR5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
1700001F09RikQ9DAR5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700001F09RikQ9DAR5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700001F09RikQ9DAR5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700001F09RikQ9DAR5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700001F09RikQ9DAR5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700001F09RikQ9DAR5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700001F09RikQ9DAR5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700001F09RikQ9DAR5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700001F09RikQ9DAR5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700001F09RikQ9DAR5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700001F09RikQ9DAR5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700001F09RikQ9DAR5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700001F09RikQ9DAR5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700001F09RikQ9DAR5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700001F09RikQ9DAR5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700001F09RikQ9DAR5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700001F09RikQ9DAR5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700001F09RikQ9DAR5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700001F09RikQ9DAR5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700001F09RikQ9DAR5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700001F09RikQ9DAR5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700001F09RikQ9DAR5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700001F09RikQ9DAR5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700001F09RikQ9DAR5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700001F09RikQ9DAR5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700001F09RikQ9DAR5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700001F09RikQ9DAR5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700001F09RikQ9DAR5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700001F09RikQ9DAR5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700001F09RikQ9DAR5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700001F09RikQ9DAR5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700001F09RikQ9DAR5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700001F09RikQ9DAR5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700001F09RikQ9DAR5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
1700001F09RikQ9DAR5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700001F09RikQ9DAR5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700001F09RikQ9DAR5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700001F09RikQ9DAR5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700001F09RikQ9DAR5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700001F09RikQ9DAR5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700001F09RikQ9DAR5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms