Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atg3Q9CPX6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atg3Q9CPX6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atg3Q9CPX6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atg3Q9CPX6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atg3Q9CPX6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atg3Q9CPX6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atg3Q9CPX6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Atg3Q9CPX6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Atg3Q9CPX6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atg3Q9CPX6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atg3Q9CPX6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atg3Q9CPX6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atg3Q9CPX6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atg3Q9CPX6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atg3Q9CPX6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atg3Q9CPX6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Atg3Q9CPX6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Atg3Q9CPX6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Atg3Q9CPX6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atg3Q9CPX6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atg3Q9CPX6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atg3Q9CPX6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atg3Q9CPX6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atg3Q9CPX6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atg3Q9CPX6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atg3Q9CPX6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atg3Q9CPX6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Atg3Q9CPX6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atg3Q9CPX6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atg3Q9CPX6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atg3Q9CPX6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Atg3Q9CPX6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atg3Q9CPX6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atg3Q9CPX6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atg3Q9CPX6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atg3Q9CPX6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atg3Q9CPX6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atg3Q9CPX6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Atg3Q9CPX6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atg3Q9CPX6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atg3Q9CPX6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atg3Q9CPX6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atg3Q9CPX6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atg3Q9CPX6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atg3Q9CPX6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atg3Q9CPX6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atg3Q9CPX6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atg3Q9CPX6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atg3Q9CPX6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atg3Q9CPX6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atg3Q9CPX6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atg3Q9CPX6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atg3Q9CPX6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atg3Q9CPX6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atg3Q9CPX6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Atg3Q9CPX6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Atg3Q9CPX6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atg3Q9CPX6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atg3Q9CPX6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atg3Q9CPX6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atg3Q9CPX6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atg3Q9CPX6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atg3Q9CPX6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atg3Q9CPX6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Atg3Q9CPX6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atg3Q9CPX6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atg3Q9CPX6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atg3Q9CPX6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atg3Q9CPX6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atg3Q9CPX6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atg3Q9CPX6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atg3Q9CPX6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atg3Q9CPX6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atg3Q9CPX6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atg3Q9CPX6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atg3Q9CPX6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Atg3Q9CPX6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Atg3Q9CPX6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atg3Q9CPX6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Atg3Q9CPX6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atg3Q9CPX6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atg3Q9CPX6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atg3Q9CPX6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Atg3Q9CPX6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atg3Q9CPX6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atg3Q9CPX6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atg3Q9CPX6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atg3Q9CPX6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atg3Q9CPX6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atg3Q9CPX6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atg3Q9CPX6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atg3Q9CPX6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atg3Q9CPX6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atg3Q9CPX6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Atg3Q9CPX6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Atg3Q9CPX6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atg3Q9CPX6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atg3Q9CPX6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atg3Q9CPX6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms