Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
VTI1AQ96AJ9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
VTI1AQ96AJ9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VTI1AQ96AJ9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VTI1AQ96AJ9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VTI1AQ96AJ9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VTI1AQ96AJ9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VTI1AQ96AJ9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VTI1AQ96AJ9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VTI1AQ96AJ9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VTI1AQ96AJ9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
VTI1AQ96AJ9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VTI1AQ96AJ9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VTI1AQ96AJ9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VTI1AQ96AJ9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
VTI1AQ96AJ9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VTI1AQ96AJ9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VTI1AQ96AJ9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VTI1AQ96AJ9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VTI1AQ96AJ9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VTI1AQ96AJ9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VTI1AQ96AJ9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VTI1AQ96AJ9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VTI1AQ96AJ9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VTI1AQ96AJ9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VTI1AQ96AJ9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
VTI1AQ96AJ9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
VTI1AQ96AJ9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
VTI1AQ96AJ9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
VTI1AQ96AJ9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
VTI1AQ96AJ9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VTI1AQ96AJ9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VTI1AQ96AJ9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VTI1AQ96AJ9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VTI1AQ96AJ9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
VTI1AQ96AJ9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VTI1AQ96AJ9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VTI1AQ96AJ9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VTI1AQ96AJ9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
VTI1AQ96AJ9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VTI1AQ96AJ9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
VTI1AQ96AJ9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VTI1AQ96AJ9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VTI1AQ96AJ9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
VTI1AQ96AJ9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VTI1AQ96AJ9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VTI1AQ96AJ9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VTI1AQ96AJ9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VTI1AQ96AJ9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VTI1AQ96AJ9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VTI1AQ96AJ9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VTI1AQ96AJ9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VTI1AQ96AJ9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VTI1AQ96AJ9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VTI1AQ96AJ9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VTI1AQ96AJ9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VTI1AQ96AJ9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VTI1AQ96AJ9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VTI1AQ96AJ9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VTI1AQ96AJ9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
VTI1AQ96AJ9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VTI1AQ96AJ9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VTI1AQ96AJ9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VTI1AQ96AJ9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VTI1AQ96AJ9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VTI1AQ96AJ9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VTI1AQ96AJ9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VTI1AQ96AJ9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VTI1AQ96AJ9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VTI1AQ96AJ9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VTI1AQ96AJ9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VTI1AQ96AJ9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VTI1AQ96AJ9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VTI1AQ96AJ9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
VTI1AQ96AJ9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VTI1AQ96AJ9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VTI1AQ96AJ9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VTI1AQ96AJ9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VTI1AQ96AJ9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VTI1AQ96AJ9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
VTI1AQ96AJ9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VTI1AQ96AJ9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
VTI1AQ96AJ9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VTI1AQ96AJ9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VTI1AQ96AJ9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VTI1AQ96AJ9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VTI1AQ96AJ9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VTI1AQ96AJ9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VTI1AQ96AJ9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
VTI1AQ96AJ9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VTI1AQ96AJ9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VTI1AQ96AJ9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VTI1AQ96AJ9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VTI1AQ96AJ9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VTI1AQ96AJ9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
VTI1AQ96AJ9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VTI1AQ96AJ9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VTI1AQ96AJ9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VTI1AQ96AJ9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VTI1AQ96AJ9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms