Protein–RNA interactions for Protein: Q92620

DHX38, Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX38Q92620 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX38Q92620 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX38Q92620 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX38Q92620 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX38Q92620 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX38Q92620 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX38Q92620 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX38Q92620 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX38Q92620 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX38Q92620 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX38Q92620 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX38Q92620 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX38Q92620 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX38Q92620 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX38Q92620 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX38Q92620 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX38Q92620 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX38Q92620 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX38Q92620 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX38Q92620 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX38Q92620 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX38Q92620 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX38Q92620 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX38Q92620 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX38Q92620 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX38Q92620 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX38Q92620 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DHX38Q92620 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DHX38Q92620 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DHX38Q92620 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DHX38Q92620 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DHX38Q92620 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DHX38Q92620 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DHX38Q92620 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DHX38Q92620 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DHX38Q92620 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DHX38Q92620 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DHX38Q92620 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DHX38Q92620 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DHX38Q92620 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DHX38Q92620 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DHX38Q92620 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DHX38Q92620 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DHX38Q92620 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DHX38Q92620 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DHX38Q92620 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DHX38Q92620 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DHX38Q92620 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DHX38Q92620 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DHX38Q92620 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DHX38Q92620 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DHX38Q92620 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DHX38Q92620 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DHX38Q92620 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DHX38Q92620 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DHX38Q92620 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DHX38Q92620 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DHX38Q92620 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DHX38Q92620 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DHX38Q92620 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DHX38Q92620 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DHX38Q92620 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DHX38Q92620 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DHX38Q92620 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DHX38Q92620 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DHX38Q92620 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DHX38Q92620 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DHX38Q92620 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DHX38Q92620 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DHX38Q92620 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DHX38Q92620 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DHX38Q92620 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DHX38Q92620 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DHX38Q92620 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DHX38Q92620 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DHX38Q92620 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DHX38Q92620 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DHX38Q92620 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DHX38Q92620 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DHX38Q92620 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DHX38Q92620 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DHX38Q92620 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DHX38Q92620 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DHX38Q92620 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DHX38Q92620 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX38Q92620 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX38Q92620 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX38Q92620 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX38Q92620 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX38Q92620 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX38Q92620 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX38Q92620 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX38Q92620 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX38Q92620 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DHX38Q92620 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DHX38Q92620 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DHX38Q92620 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DHX38Q92620 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DHX38Q92620 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
DHX38Q92620 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms