Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE97

Srsf4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf4Q8VE97 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srsf4Q8VE97 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srsf4Q8VE97 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srsf4Q8VE97 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srsf4Q8VE97 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srsf4Q8VE97 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srsf4Q8VE97 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srsf4Q8VE97 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srsf4Q8VE97 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srsf4Q8VE97 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srsf4Q8VE97 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srsf4Q8VE97 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf4Q8VE97 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf4Q8VE97 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf4Q8VE97 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf4Q8VE97 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf4Q8VE97 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf4Q8VE97 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf4Q8VE97 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf4Q8VE97 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf4Q8VE97 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf4Q8VE97 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf4Q8VE97 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf4Q8VE97 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf4Q8VE97 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf4Q8VE97 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf4Q8VE97 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srsf4Q8VE97 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srsf4Q8VE97 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srsf4Q8VE97 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srsf4Q8VE97 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srsf4Q8VE97 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srsf4Q8VE97 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srsf4Q8VE97 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srsf4Q8VE97 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srsf4Q8VE97 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srsf4Q8VE97 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srsf4Q8VE97 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srsf4Q8VE97 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srsf4Q8VE97 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srsf4Q8VE97 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Srsf4Q8VE97 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srsf4Q8VE97 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf4Q8VE97 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf4Q8VE97 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf4Q8VE97 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf4Q8VE97 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf4Q8VE97 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf4Q8VE97 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf4Q8VE97 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf4Q8VE97 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf4Q8VE97 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf4Q8VE97 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srsf4Q8VE97 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Srsf4Q8VE97 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Srsf4Q8VE97 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Srsf4Q8VE97 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Srsf4Q8VE97 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Srsf4Q8VE97 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srsf4Q8VE97 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srsf4Q8VE97 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Srsf4Q8VE97 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srsf4Q8VE97 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srsf4Q8VE97 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srsf4Q8VE97 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srsf4Q8VE97 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srsf4Q8VE97 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf4Q8VE97 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf4Q8VE97 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf4Q8VE97 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf4Q8VE97 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf4Q8VE97 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf4Q8VE97 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf4Q8VE97 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf4Q8VE97 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf4Q8VE97 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf4Q8VE97 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf4Q8VE97 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf4Q8VE97 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srsf4Q8VE97 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srsf4Q8VE97 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srsf4Q8VE97 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srsf4Q8VE97 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srsf4Q8VE97 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srsf4Q8VE97 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srsf4Q8VE97 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srsf4Q8VE97 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srsf4Q8VE97 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srsf4Q8VE97 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf4Q8VE97 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf4Q8VE97 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf4Q8VE97 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf4Q8VE97 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf4Q8VE97 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf4Q8VE97 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf4Q8VE97 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf4Q8VE97 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf4Q8VE97 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf4Q8VE97 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf4Q8VE97 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms