Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP43Q70EL4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP43Q70EL4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
USP43Q70EL4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
USP43Q70EL4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
USP43Q70EL4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP43Q70EL4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP43Q70EL4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP43Q70EL4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP43Q70EL4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
USP43Q70EL4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP43Q70EL4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP43Q70EL4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
USP43Q70EL4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP43Q70EL4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP43Q70EL4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP43Q70EL4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
USP43Q70EL4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP43Q70EL4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP43Q70EL4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP43Q70EL4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP43Q70EL4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP43Q70EL4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP43Q70EL4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP43Q70EL4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
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