Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC149Q6ZUS6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC149Q6ZUS6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC149Q6ZUS6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC149Q6ZUS6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC149Q6ZUS6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC149Q6ZUS6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC149Q6ZUS6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC149Q6ZUS6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC149Q6ZUS6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC149Q6ZUS6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC149Q6ZUS6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC149Q6ZUS6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC149Q6ZUS6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC149Q6ZUS6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC149Q6ZUS6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC149Q6ZUS6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC149Q6ZUS6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC149Q6ZUS6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC149Q6ZUS6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC149Q6ZUS6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC149Q6ZUS6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC149Q6ZUS6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC149Q6ZUS6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC149Q6ZUS6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC149Q6ZUS6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC149Q6ZUS6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC149Q6ZUS6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC149Q6ZUS6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC149Q6ZUS6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC149Q6ZUS6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC149Q6ZUS6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC149Q6ZUS6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC149Q6ZUS6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC149Q6ZUS6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC149Q6ZUS6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC149Q6ZUS6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC149Q6ZUS6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC149Q6ZUS6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC149Q6ZUS6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC149Q6ZUS6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC149Q6ZUS6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC149Q6ZUS6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC149Q6ZUS6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC149Q6ZUS6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC149Q6ZUS6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC149Q6ZUS6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC149Q6ZUS6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms