Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SUSD1Q6UWL2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD1Q6UWL2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms