Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0T0

MARCH8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH8Q5T0T0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MARCH8Q5T0T0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MARCH8Q5T0T0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MARCH8Q5T0T0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MARCH8Q5T0T0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MARCH8Q5T0T0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MARCH8Q5T0T0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MARCH8Q5T0T0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MARCH8Q5T0T0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MARCH8Q5T0T0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MARCH8Q5T0T0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MARCH8Q5T0T0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MARCH8Q5T0T0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MARCH8Q5T0T0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MARCH8Q5T0T0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MARCH8Q5T0T0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MARCH8Q5T0T0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MARCH8Q5T0T0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MARCH8Q5T0T0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MARCH8Q5T0T0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MARCH8Q5T0T0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MARCH8Q5T0T0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MARCH8Q5T0T0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MARCH8Q5T0T0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MARCH8Q5T0T0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MARCH8Q5T0T0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MARCH8Q5T0T0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MARCH8Q5T0T0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MARCH8Q5T0T0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MARCH8Q5T0T0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MARCH8Q5T0T0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MARCH8Q5T0T0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MARCH8Q5T0T0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MARCH8Q5T0T0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MARCH8Q5T0T0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MARCH8Q5T0T0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms