Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms