Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DCAF6Q58WW2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DCAF6Q58WW2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DCAF6Q58WW2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms