Protein–RNA interactions for Protein: Q3V063

4933416C03Rik, MCG64776, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933416C03RikQ3V063 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
4933416C03RikQ3V063 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
4933416C03RikQ3V063 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
4933416C03RikQ3V063 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
4933416C03RikQ3V063 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
4933416C03RikQ3V063 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
4933416C03RikQ3V063 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
4933416C03RikQ3V063 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
4933416C03RikQ3V063 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
4933416C03RikQ3V063 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
4933416C03RikQ3V063 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
4933416C03RikQ3V063 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
4933416C03RikQ3V063 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
4933416C03RikQ3V063 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
4933416C03RikQ3V063 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
4933416C03RikQ3V063 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
4933416C03RikQ3V063 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
4933416C03RikQ3V063 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
4933416C03RikQ3V063 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
4933416C03RikQ3V063 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
4933416C03RikQ3V063 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
4933416C03RikQ3V063 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
4933416C03RikQ3V063 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
4933416C03RikQ3V063 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
4933416C03RikQ3V063 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
4933416C03RikQ3V063 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
4933416C03RikQ3V063 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
4933416C03RikQ3V063 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
4933416C03RikQ3V063 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
4933416C03RikQ3V063 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
4933416C03RikQ3V063 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
4933416C03RikQ3V063 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
4933416C03RikQ3V063 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
4933416C03RikQ3V063 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
4933416C03RikQ3V063 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
4933416C03RikQ3V063 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
4933416C03RikQ3V063 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
4933416C03RikQ3V063 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
4933416C03RikQ3V063 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
4933416C03RikQ3V063 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
4933416C03RikQ3V063 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
4933416C03RikQ3V063 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
4933416C03RikQ3V063 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
4933416C03RikQ3V063 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
4933416C03RikQ3V063 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
4933416C03RikQ3V063 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
4933416C03RikQ3V063 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
4933416C03RikQ3V063 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
4933416C03RikQ3V063 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
4933416C03RikQ3V063 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
4933416C03RikQ3V063 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
4933416C03RikQ3V063 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
4933416C03RikQ3V063 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
4933416C03RikQ3V063 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
4933416C03RikQ3V063 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
4933416C03RikQ3V063 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
4933416C03RikQ3V063 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
4933416C03RikQ3V063 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
4933416C03RikQ3V063 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
4933416C03RikQ3V063 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
4933416C03RikQ3V063 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
4933416C03RikQ3V063 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
4933416C03RikQ3V063 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
4933416C03RikQ3V063 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
4933416C03RikQ3V063 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
4933416C03RikQ3V063 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
4933416C03RikQ3V063 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
4933416C03RikQ3V063 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
4933416C03RikQ3V063 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
4933416C03RikQ3V063 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
4933416C03RikQ3V063 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
4933416C03RikQ3V063 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
4933416C03RikQ3V063 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
4933416C03RikQ3V063 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
4933416C03RikQ3V063 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
4933416C03RikQ3V063 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
4933416C03RikQ3V063 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
4933416C03RikQ3V063 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
4933416C03RikQ3V063 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
4933416C03RikQ3V063 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
4933416C03RikQ3V063 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
4933416C03RikQ3V063 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
4933416C03RikQ3V063 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
4933416C03RikQ3V063 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
4933416C03RikQ3V063 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
4933416C03RikQ3V063 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
4933416C03RikQ3V063 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
4933416C03RikQ3V063 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
4933416C03RikQ3V063 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
4933416C03RikQ3V063 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
4933416C03RikQ3V063 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
4933416C03RikQ3V063 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
4933416C03RikQ3V063 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
4933416C03RikQ3V063 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
4933416C03RikQ3V063 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
4933416C03RikQ3V063 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
4933416C03RikQ3V063 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
4933416C03RikQ3V063 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
4933416C03RikQ3V063 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
4933416C03RikQ3V063 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms