Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTD9

Smim15, Small integral membrane protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim15Q3UTD9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smim15Q3UTD9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim15Q3UTD9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms