Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ81

Cnep1r1, Nuclear envelope phosphatase-regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnep1r1Q3UJ81 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnep1r1Q3UJ81 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cnep1r1Q3UJ81 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms