Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hdgfl1Q2VPR5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdgfl1Q2VPR5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdgfl1Q2VPR5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdgfl1Q2VPR5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdgfl1Q2VPR5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdgfl1Q2VPR5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdgfl1Q2VPR5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdgfl1Q2VPR5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hdgfl1Q2VPR5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdgfl1Q2VPR5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdgfl1Q2VPR5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdgfl1Q2VPR5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdgfl1Q2VPR5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdgfl1Q2VPR5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdgfl1Q2VPR5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdgfl1Q2VPR5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdgfl1Q2VPR5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdgfl1Q2VPR5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdgfl1Q2VPR5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdgfl1Q2VPR5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdgfl1Q2VPR5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdgfl1Q2VPR5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdgfl1Q2VPR5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdgfl1Q2VPR5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdgfl1Q2VPR5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdgfl1Q2VPR5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdgfl1Q2VPR5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms