Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGSM1Q2NKQ1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGSM1Q2NKQ1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGSM1Q2NKQ1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGSM1Q2NKQ1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGSM1Q2NKQ1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGSM1Q2NKQ1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGSM1Q2NKQ1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGSM1Q2NKQ1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGSM1Q2NKQ1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGSM1Q2NKQ1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGSM1Q2NKQ1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGSM1Q2NKQ1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGSM1Q2NKQ1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGSM1Q2NKQ1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGSM1Q2NKQ1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SGSM1Q2NKQ1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGSM1Q2NKQ1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGSM1Q2NKQ1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGSM1Q2NKQ1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGSM1Q2NKQ1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGSM1Q2NKQ1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SGSM1Q2NKQ1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SGSM1Q2NKQ1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SGSM1Q2NKQ1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SGSM1Q2NKQ1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGSM1Q2NKQ1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGSM1Q2NKQ1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGSM1Q2NKQ1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGSM1Q2NKQ1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGSM1Q2NKQ1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGSM1Q2NKQ1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGSM1Q2NKQ1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SGSM1Q2NKQ1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGSM1Q2NKQ1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGSM1Q2NKQ1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGSM1Q2NKQ1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGSM1Q2NKQ1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGSM1Q2NKQ1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGSM1Q2NKQ1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SGSM1Q2NKQ1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGSM1Q2NKQ1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGSM1Q2NKQ1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGSM1Q2NKQ1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGSM1Q2NKQ1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGSM1Q2NKQ1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGSM1Q2NKQ1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGSM1Q2NKQ1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGSM1Q2NKQ1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGSM1Q2NKQ1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGSM1Q2NKQ1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGSM1Q2NKQ1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGSM1Q2NKQ1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGSM1Q2NKQ1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SGSM1Q2NKQ1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SGSM1Q2NKQ1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGSM1Q2NKQ1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGSM1Q2NKQ1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGSM1Q2NKQ1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGSM1Q2NKQ1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGSM1Q2NKQ1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGSM1Q2NKQ1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGSM1Q2NKQ1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGSM1Q2NKQ1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGSM1Q2NKQ1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGSM1Q2NKQ1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGSM1Q2NKQ1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGSM1Q2NKQ1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGSM1Q2NKQ1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGSM1Q2NKQ1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGSM1Q2NKQ1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGSM1Q2NKQ1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGSM1Q2NKQ1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGSM1Q2NKQ1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGSM1Q2NKQ1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
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