Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN2CQ14957 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN2CQ14957 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN2CQ14957 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN2CQ14957 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN2CQ14957 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN2CQ14957 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN2CQ14957 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN2CQ14957 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN2CQ14957 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN2CQ14957 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN2CQ14957 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN2CQ14957 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN2CQ14957 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN2CQ14957 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN2CQ14957 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN2CQ14957 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN2CQ14957 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN2CQ14957 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN2CQ14957 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN2CQ14957 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN2CQ14957 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN2CQ14957 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN2CQ14957 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN2CQ14957 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN2CQ14957 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN2CQ14957 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN2CQ14957 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN2CQ14957 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN2CQ14957 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN2CQ14957 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN2CQ14957 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN2CQ14957 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN2CQ14957 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN2CQ14957 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN2CQ14957 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN2CQ14957 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN2CQ14957 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN2CQ14957 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN2CQ14957 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN2CQ14957 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN2CQ14957 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN2CQ14957 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN2CQ14957 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN2CQ14957 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN2CQ14957 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN2CQ14957 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN2CQ14957 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN2CQ14957 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN2CQ14957 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN2CQ14957 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN2CQ14957 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN2CQ14957 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN2CQ14957 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN2CQ14957 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN2CQ14957 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN2CQ14957 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN2CQ14957 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN2CQ14957 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN2CQ14957 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN2CQ14957 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN2CQ14957 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN2CQ14957 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN2CQ14957 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN2CQ14957 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN2CQ14957 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN2CQ14957 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN2CQ14957 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN2CQ14957 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN2CQ14957 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN2CQ14957 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN2CQ14957 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN2CQ14957 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN2CQ14957 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN2CQ14957 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN2CQ14957 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN2CQ14957 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN2CQ14957 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN2CQ14957 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN2CQ14957 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIN2CQ14957 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1062.2 ms