Protein–RNA interactions for Protein: Q13507

TRPC3, Short transient receptor potential channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC3Q13507 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRPC3Q13507 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRPC3Q13507 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRPC3Q13507 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRPC3Q13507 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRPC3Q13507 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRPC3Q13507 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRPC3Q13507 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRPC3Q13507 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TRPC3Q13507 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TRPC3Q13507 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TRPC3Q13507 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TRPC3Q13507 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRPC3Q13507 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRPC3Q13507 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRPC3Q13507 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRPC3Q13507 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TRPC3Q13507 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRPC3Q13507 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRPC3Q13507 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRPC3Q13507 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRPC3Q13507 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRPC3Q13507 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRPC3Q13507 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRPC3Q13507 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRPC3Q13507 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TRPC3Q13507 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRPC3Q13507 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRPC3Q13507 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRPC3Q13507 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRPC3Q13507 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRPC3Q13507 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRPC3Q13507 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TRPC3Q13507 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRPC3Q13507 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRPC3Q13507 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRPC3Q13507 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRPC3Q13507 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRPC3Q13507 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRPC3Q13507 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRPC3Q13507 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRPC3Q13507 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRPC3Q13507 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRPC3Q13507 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRPC3Q13507 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRPC3Q13507 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRPC3Q13507 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRPC3Q13507 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRPC3Q13507 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRPC3Q13507 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRPC3Q13507 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRPC3Q13507 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRPC3Q13507 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRPC3Q13507 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRPC3Q13507 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRPC3Q13507 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPC3Q13507 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPC3Q13507 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPC3Q13507 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPC3Q13507 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPC3Q13507 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPC3Q13507 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPC3Q13507 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPC3Q13507 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRPC3Q13507 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRPC3Q13507 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRPC3Q13507 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRPC3Q13507 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRPC3Q13507 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPC3Q13507 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPC3Q13507 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPC3Q13507 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPC3Q13507 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPC3Q13507 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPC3Q13507 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPC3Q13507 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPC3Q13507 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPC3Q13507 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPC3Q13507 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPC3Q13507 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPC3Q13507 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPC3Q13507 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPC3Q13507 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPC3Q13507 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPC3Q13507 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRPC3Q13507 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRPC3Q13507 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRPC3Q13507 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRPC3Q13507 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRPC3Q13507 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRPC3Q13507 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRPC3Q13507 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRPC3Q13507 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRPC3Q13507 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRPC3Q13507 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRPC3Q13507 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRPC3Q13507 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPC3Q13507 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPC3Q13507 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPC3Q13507 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
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