Protein–RNA interactions for Protein: Q13242

SRSF9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF9Q13242 YTHDF2-206ENST00000478283 2594 ntTSL 1 (best)13.35□□□□□ -0.271e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.294e-12■■□□□ 12
SRSF9Q13242 PGS1-209ENST00000588169 1700 ntTSL 213.15□□□□□ -0.31e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.32e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 SDR39U1-218ENST00000556262 1960 ntTSL 213.09□□□□□ -0.312e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 PGS1-212ENST00000589426 2033 ntTSL 1 (best)13.06□□□□□ -0.321e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 PGS1-211ENST00000589425 1944 ntTSL 1 (best)13.04□□□□□ -0.321e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 DCAF8-208ENST00000461888 2277 ntTSL 512.93□□□□□ -0.344e-12■■□□□ 12
SRSF9Q13242 DECR2-216ENST00000633348 762 ntTSL 312.83□□□□□ -0.361e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 SDR39U1-220ENST00000556548 2336 ntTSL 212.78□□□□□ -0.362e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.391e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.441e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 FNBP4-213ENST00000534003 2515 ntTSL 512.21□□□□□ -0.451e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 MIR34AHG-202ENST00000635405 529 ntTSL 412.19□□□□□ -0.463e-8■■□□□ 12
SRSF9Q13242 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.464e-12■■□□□ 12
SRSF9Q13242 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.461e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 DECR2-204ENST00000437024 1738 ntTSL 212.05□□□□□ -0.481e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 DECR2-217ENST00000633923 509 ntTSL 311.9□□□□□ -0.51e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 SDR39U1-203ENST00000544691 1507 ntTSL 1 (best)11.84□□□□□ -0.512e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 DECR2-206ENST00000445291 1078 ntTSL 511.81□□□□□ -0.521e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 GLYCTK-208ENST00000486393 2019 ntTSL 1 (best)11.76□□□□□ -0.531e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 MIR34AHG-201ENST00000437157 409 ntTSL 511.74□□□□□ -0.533e-8■■□□□ 12
SRSF9Q13242 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.541e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 NME4-205ENST00000444498 1111 ntTSL 311.57□□□□□ -0.561e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 DECR2-205ENST00000439661 1618 ntTSL 211.49□□□□□ -0.571e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.621e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 DCAF8-207ENST00000447377 728 ntTSL 211.14□□□□□ -0.634e-12■■□□□ 12
SRSF9Q13242 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.631e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.631e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 YTHDF2-203ENST00000474884 864 ntTSL 511□□□□□ -0.651e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 PGS1-210ENST00000588281 1776 ntTSL 1 (best)10.96□□□□□ -0.651e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.662e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.672e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 YTHDF2-207ENST00000496288 879 ntTSL 210.78□□□□□ -0.681e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.691e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.74e-12■■□□□ 12
SRSF9Q13242 GLYCTK-206ENST00000473583 1021 ntTSL 1 (best)10.54□□□□□ -0.721e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 DECR2-203ENST00000429116 721 ntTSL 310.33□□□□□ -0.761e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 TRIM65-204ENST00000543309 865 ntTSL 210.27□□□□□ -0.772e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 PGS1-202ENST00000585521 721 ntTSL 510.17□□□□□ -0.781e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 DECR2-210ENST00000465166 702 ntTSL 210.1□□□□□ -0.791e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 FNBP4-201ENST00000263773 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.821e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.822e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 PGS1-214ENST00000591996 3062 ntTSL 1 (best)9.75□□□□□ -0.851e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 YTHDF2-208ENST00000541996 2719 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.861e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 DECR2-209ENST00000461947 1017 ntTSL 59.64□□□□□ -0.871e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 SDR39U1-215ENST00000555830 418 ntTSL 39.62□□□□□ -0.872e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 AL139011.2-201ENST00000556710 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.884e-12■■□□□ 12
SRSF9Q13242 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.931e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 DECR2-215ENST00000633025 561 ntTSL 58.97□□□□□ -0.971e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 FNBP4-202ENST00000524696 481 ntTSL 38.6□□□□□ -1.031e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 DCAF8-202ENST00000368073 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.044e-12■■□□□ 12
SRSF9Q13242 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.061e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 ANKRD20A5P-206ENST00000581363 582 ntTSL 38.39□□□□□ -1.071e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 DCAF8-205ENST00000419626 439 ntTSL 27.39□□□□□ -1.234e-12■■□□□ 12
SRSF9Q13242 ANKRD20A5P-201ENST00000431648 3556 ntBASIC7.34□□□□□ -1.231e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 PGS1-205ENST00000586355 584 ntTSL 47.12□□□□□ -1.271e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 FNBP4-210ENST00000531394 605 ntTSL 37□□□□□ -1.291e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 PGS1-203ENST00000586019 572 ntTSL 46.6□□□□□ -1.351e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 DCAF8-204ENST00000407642 517 ntTSL 26.53□□□□□ -1.364e-12■■□□□ 12
SRSF9Q13242 DCAF8-203ENST00000368074 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.44e-12■■□□□ 12
SRSF9Q13242 FNBP4-204ENST00000525792 840 ntTSL 35.96□□□□□ -1.461e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 AL139011.2-202ENST00000485079 914 ntTSL 35.86□□□□□ -1.474e-12■■□□□ 12
SRSF9Q13242 OSTM1-202ENST00000440575 724 ntTSL 55.69□□□□□ -1.51e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 SDR39U1-207ENST00000553937 217 ntTSL 35.59□□□□□ -1.512e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 DCAF8-206ENST00000440682 501 ntTSL 34.51□□□□□ -1.694e-12■■□□□ 12
SRSF9Q13242 FNBP4-207ENST00000528388 814 ntTSL 23.86□□□□□ -1.791e-6■■□□□ 12
SRSF9Q13242 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.697e-7■■□□□ 12
SRSF9Q13242 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.767e-7■■□□□ 12
SRSF9Q13242 NAP1L1-216ENST00000549596 1838 ntTSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.127e-7■■□□□ 12
SRSF9Q13242 NAP1L1-210ENST00000547773 1967 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.137e-7■■□□□ 12
SRSF9Q13242 NAP1L1-203ENST00000431879 2031 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.177e-7■■□□□ 12
SRSF9Q13242 NAP1L1-206ENST00000544816 1597 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.217e-7■■□□□ 12
SRSF9Q13242 NAP1L1-205ENST00000542344 1675 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.237e-7■■□□□ 12
SRSF9Q13242 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.477e-7■■□□□ 12
SRSF9Q13242 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.867e-7■■□□□ 12
SRSF9Q13242 NAP1L1-224ENST00000552056 1981 ntTSL 53.34□□□□□ -1.877e-7■■□□□ 12
SRSF9Q13242 NAP1L1-225ENST00000552147 1009 ntTSL 53.11□□□□□ -1.917e-7■■□□□ 12
SRSF9Q13242 MTG1-204ENST00000473735 2212 ntTSL 516.29■□□□□ 0.21e-11■■□□□ 12
SRSF9Q13242 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.561e-11■■□□□ 12
SRSF9Q13242 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.611e-11■■□□□ 12
SRSF9Q13242 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.621e-11■■□□□ 12
SRSF9Q13242 MTG1-202ENST00000432508 953 ntTSL 210.63□□□□□ -0.711e-11■■□□□ 12
SRSF9Q13242 MTG1-203ENST00000460848 2730 ntTSL 210.52□□□□□ -0.721e-11■■□□□ 12
SRSF9Q13242 MTG1-206ENST00000492266 413 ntTSL 26.64□□□□□ -1.351e-11■■□□□ 12
SRSF9Q13242 DHRS2-208ENST00000556729 5318 ntTSL 213.75□□□□□ -0.211e-18■■□□□ 12
SRSF9Q13242 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.261e-18■■□□□ 12
SRSF9Q13242 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.361e-18■■□□□ 12
SRSF9Q13242 DHRS2-203ENST00000432832 834 ntTSL 212.45□□□□□ -0.421e-18■■□□□ 12
SRSF9Q13242 DHRS2-205ENST00000553896 1352 ntTSL 1 (best)12.41□□□□□ -0.421e-18■■□□□ 12
SRSF9Q13242 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.591e-18■■□□□ 12
SRSF9Q13242 DHRS2-207ENST00000556701 3157 ntTSL 1 (best)11.27□□□□□ -0.611e-18■■□□□ 12
SRSF9Q13242 DHRS2-209ENST00000557535 927 ntTSL 510.53□□□□□ -0.721e-18■■□□□ 12
SRSF9Q13242 DHRS2-204ENST00000553600 844 ntTSL 29.39□□□□□ -0.911e-18■■□□□ 12
SRSF9Q13242 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.031e-8■■□□□ 12
SRSF9Q13242 NOP56-209ENST00000469588 950 ntTSL 212.86□□□□□ -0.351e-8■■□□□ 12
SRSF9Q13242 NOP56-218ENST00000496775 729 ntTSL 28.3□□□□□ -1.081e-8■■□□□ 12
SRSF9Q13242 NOP56-203ENST00000445139 856 ntTSL 58.1□□□□□ -1.111e-8■■□□□ 12
SRSF9Q13242 NOP56-217ENST00000494697 919 ntTSL 58.03□□□□□ -1.121e-8■■□□□ 12
SRSF9Q13242 NOP56-213ENST00000480992 929 ntTSL 57.83□□□□□ -1.161e-8■■□□□ 12
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