Protein–RNA interactions for Protein: Q12377

RPN6, 26S proteasome regulatory subunit RPN6, yeastyeast

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPN6Q12377 SIR2YDL042C 1689 nt4.58□□□□□ -1.68
RPN6Q12377 MSE1YOL033W 1611 nt4.58□□□□□ -1.68
RPN6Q12377 HRR25YPL204W 1485 nt4.58□□□□□ -1.68
RPN6Q12377 RVB1YDR190C 1392 nt4.58□□□□□ -1.68
RPN6Q12377 RAM1YDL090C 1296 nt4.58□□□□□ -1.68
RPN6Q12377 NOP16YER002W 696 nt4.58□□□□□ -1.68
RPN6Q12377 CSR1YLR380W 1227 nt4.58□□□□□ -1.68
RPN6Q12377 YMR030W-AYMR030W-A 291 nt4.58□□□□□ -1.68
RPN6Q12377 CKB2YOR039W 777 nt4.58□□□□□ -1.68
RPN6Q12377 ABF1YKL112W 2196 nt4.58□□□□□ -1.68
RPN6Q12377 YTA12YMR089C 2478 nt4.57□□□□□ -1.68
RPN6Q12377 APE1YKL103C 1545 nt4.57□□□□□ -1.68
RPN6Q12377 SER33YIL074C 1410 nt4.57□□□□□ -1.68
RPN6Q12377 ASP1YDR321W 1146 nt4.57□□□□□ -1.68
RPN6Q12377 YEL045CYEL045C 426 nt4.57□□□□□ -1.68
RPN6Q12377 PML1YLR016C 615 nt4.57□□□□□ -1.68
RPN6Q12377 TGS1YPL157W 948 nt4.57□□□□□ -1.68
RPN6Q12377 MAK3YPR051W 531 nt4.57□□□□□ -1.68
RPN6Q12377 MMR1YLR190W 1476 nt4.56□□□□□ -1.68
RPN6Q12377 COT1YOR316C 1320 nt4.56□□□□□ -1.68
RPN6Q12377 HST4YDR191W 1113 nt4.56□□□□□ -1.68
RPN6Q12377 SUT1YGL162W 900 nt4.56□□□□□ -1.68
RPN6Q12377 SEC13YLR208W 894 nt4.56□□□□□ -1.68
RPN6Q12377 RSA3YLR221C 663 nt4.56□□□□□ -1.68
RPN6Q12377 OCA1YNL099C 717 nt4.56□□□□□ -1.68
RPN6Q12377 PHA2YNL316C 1005 nt4.56□□□□□ -1.68
RPN6Q12377 YPL199CYPL199C 723 nt4.56□□□□□ -1.68
RPN6Q12377 MPS3YJL019W 2049 nt4.56□□□□□ -1.68
RPN6Q12377 MTC1YJL123C 1437 nt4.55□□□□□ -1.68
RPN6Q12377 SUP35YDR172W 2058 nt4.55□□□□□ -1.68
RPN6Q12377 FAA4YMR246W 2085 nt4.55□□□□□ -1.68
RPN6Q12377 SKG3YLR187W 3081 nt4.55□□□□□ -1.68
RPN6Q12377 LCB2YDR062W 1686 nt4.55□□□□□ -1.68
RPN6Q12377 SYP1YCR030C 2613 nt4.55□□□□□ -1.68
RPN6Q12377 YNG2YHR090C 849 nt4.55□□□□□ -1.68
RPN6Q12377 YCL021W-AYCL021W-A 378 nt4.55□□□□□ -1.68
RPN6Q12377 RRP3YHR065C 1506 nt4.55□□□□□ -1.68
RPN6Q12377 STE12YHR084W 2067 nt4.55□□□□□ -1.68
RPN6Q12377 PUT1YLR142W 1431 nt4.55□□□□□ -1.68
RPN6Q12377 LPL1YOR059C 1353 nt4.54□□□□□ -1.68
RPN6Q12377 VID22YLR373C 2706 nt4.54□□□□□ -1.68
RPN6Q12377 SUR2YDR297W 1050 nt4.54□□□□□ -1.68
RPN6Q12377 RPL34AYER056C-A 366 nt4.54□□□□□ -1.68
RPN6Q12377 ERG3YLR056W 1098 nt4.54□□□□□ -1.68
RPN6Q12377 YAP1802YGR241C 1707 nt4.54□□□□□ -1.68
RPN6Q12377 YGR266WYGR266W 2106 nt4.54□□□□□ -1.68
RPN6Q12377 ATR1YML116W 1629 nt4.54□□□□□ -1.68
RPN6Q12377 GMC1YDR506C 1827 nt4.53□□□□□ -1.68
RPN6Q12377 TSL1YML100W 3297 nt4.53□□□□□ -1.68
RPN6Q12377 PCT1YGR202C 1275 nt4.53□□□□□ -1.68
RPN6Q12377 YPR109WYPR109W 885 nt4.53□□□□□ -1.68
RPN6Q12377 MEC3YLR288C 1425 nt4.53□□□□□ -1.68
RPN6Q12377 MCM4YPR019W 2802 nt4.53□□□□□ -1.68
RPN6Q12377 SUM1YDR310C 3189 nt4.53□□□□□ -1.68
RPN6Q12377 TUB2YFL037W 1374 nt4.53□□□□□ -1.69
RPN6Q12377 SLD2YKL108W 1362 nt4.53□□□□□ -1.69
RPN6Q12377 LEU1YGL009C 2340 nt4.52□□□□□ -1.69
RPN6Q12377 WTM1YOR230W 1314 nt4.52□□□□□ -1.69
RPN6Q12377 MRE11YMR224C 2079 nt4.52□□□□□ -1.69
RPN6Q12377 RAD30YDR419W 1899 nt4.52□□□□□ -1.69
RPN6Q12377 VHC1YBR235W 3363 nt4.52□□□□□ -1.69
RPN6Q12377 MPH2YDL247W 1830 nt4.52□□□□□ -1.69
RPN6Q12377 TFB3YDR460W 966 nt4.52□□□□□ -1.69
RPN6Q12377 SKI6YGR195W 741 nt4.52□□□□□ -1.69
RPN6Q12377 YIR043CYIR043C 693 nt4.52□□□□□ -1.69
RPN6Q12377 RPL43BYJR094W-A 279 nt4.52□□□□□ -1.69
RPN6Q12377 MID2YLR332W 1131 nt4.52□□□□□ -1.69
RPN6Q12377 YBL006W-AYBL006W-A 150 nt4.52□□□□□ -1.69
RPN6Q12377 EUG1YDR518W 1554 nt4.52□□□□□ -1.69
RPN6Q12377 CLA4YNL298W 2529 nt4.51□□□□□ -1.69
RPN6Q12377 SSB2YNL209W 1842 nt4.51□□□□□ -1.69
RPN6Q12377 DIT1YDR403W 1611 nt4.51□□□□□ -1.69
RPN6Q12377 YIL092WYIL092W 1902 nt4.51□□□□□ -1.69
RPN6Q12377 YHL049CYHL049C 816 nt4.51□□□□□ -1.69
RPN6Q12377 FMP33YJL161W 543 nt4.51□□□□□ -1.69
RPN6Q12377 CPR6YLR216C 1116 nt4.51□□□□□ -1.69
RPN6Q12377 MAC1YMR021C 1254 nt4.51□□□□□ -1.69
RPN6Q12377 OSW5YMR148W 447 nt4.51□□□□□ -1.69
RPN6Q12377 TAF5YBR198C 2397 nt4.51□□□□□ -1.69
RPN6Q12377 HXT7YDR342C 1713 nt4.51□□□□□ -1.69
RPN6Q12377 HXT6YDR343C 1713 nt4.51□□□□□ -1.69
RPN6Q12377 RRB1YMR131C 1536 nt4.51□□□□□ -1.69
RPN6Q12377 HRK1YOR267C 2280 nt4.51□□□□□ -1.69
RPN6Q12377 TUB3YML124C 1338 nt4.5□□□□□ -1.69
RPN6Q12377 IML2YJL082W 2196 nt4.5□□□□□ -1.69
RPN6Q12377 HOT1YMR172W 2160 nt4.5□□□□□ -1.69
RPN6Q12377 KAP114YGL241W 3015 nt4.5□□□□□ -1.69
RPN6Q12377 BOP2YLR267W 1713 nt4.5□□□□□ -1.69
RPN6Q12377 MNN11YJL183W 1269 nt4.5□□□□□ -1.69
RPN6Q12377 YAR019W-AYAR019W-A 333 nt4.5□□□□□ -1.69
RPN6Q12377 DRN1YGR093W 1524 nt4.5□□□□□ -1.69
RPN6Q12377 GIP1YBR045C 1920 nt4.5□□□□□ -1.69
RPN6Q12377 SDA1YGR245C 2304 nt4.5□□□□□ -1.69
RPN6Q12377 GCR2YNL199C 1605 nt4.5□□□□□ -1.69
RPN6Q12377 RTC5YOR118W 1704 nt4.49□□□□□ -1.69
RPN6Q12377 YLR283WYLR283W 945 nt4.49□□□□□ -1.69
RPN6Q12377 TOM40YMR203W 1164 nt4.49□□□□□ -1.69
RPN6Q12377 CWC25YNL245C 540 nt4.49□□□□□ -1.69
RPN6Q12377 TIP41YPR040W 1071 nt4.49□□□□□ -1.69
RPN6Q12377 LAP2YNL045W 2016 nt4.49□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 34.9 ms