Protein–RNA interactions for Protein: Q06787

FMR1, Synaptic functional regulator FMR1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMR1Q06787 FBXW11-201ENST00000265094 4342 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.222e-7■■■■■ 28.3
FMR1Q06787 POLG-223ENST00000637307 100 ntTSL 513.24□□□□□ -0.292e-7■■■■■ 28.3
FMR1Q06787 PPIL4-201ENST00000253329 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.442e-7■■■■■ 28.3
FMR1Q06787 FLNB-213ENST00000491408 475 ntTSL 36.64□□□□□ -1.352e-7■■■■■ 28.3
FMR1Q06787 FLNA-218ENST00000498491 914 ntTSL 521.27■■□□□ 11e-15■■■■■ 28.3
FMR1Q06787 LTBP4-218ENST00000597816 692 ntTSL 320.1■□□□□ 0.812e-11■■■■■ 28.2
FMR1Q06787 WWP1-210ENST00000523863 796 ntTSL 325.41■■□□□ 1.661e-6■■■■■ 28.2
FMR1Q06787 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.711e-6■■■■■ 28.2
FMR1Q06787 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.231e-6■■■■■ 28.2
FMR1Q06787 MIA3-208ENST00000475451 552 ntTSL 36.75□□□□□ -1.331e-6■■■■■ 28.2
FMR1Q06787 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.244e-8■■■■■ 28.2
FMR1Q06787 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.078e-7■■■■■ 28.2
FMR1Q06787 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.028e-7■■■■■ 28.2
FMR1Q06787 SCAF4-203ENST00000434667 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.488e-7■■■■■ 28.2
FMR1Q06787 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.823e-6■■■■■ 28.1
FMR1Q06787 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.623e-6■■■■■ 28.1
FMR1Q06787 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.423e-6■■■■■ 28.1
FMR1Q06787 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.353e-6■■■■■ 28.1
FMR1Q06787 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.353e-6■■■■■ 28.1
FMR1Q06787 BCAR1-218ENST00000566982 3024 ntTSL 217.15■□□□□ 0.343e-6■■■■■ 28.1
FMR1Q06787 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.273e-6■■■■■ 28.1
FMR1Q06787 BCAR1-222ENST00000569340 714 ntTSL 316.54■□□□□ 0.243e-6■■■■■ 28.1
FMR1Q06787 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.163e-6■■■■■ 28.1
FMR1Q06787 BCAR1-211ENST00000562556 4659 ntTSL 214.31□□□□□ -0.123e-6■■■■■ 28.1
FMR1Q06787 BCAR1-203ENST00000393422 4064 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.193e-6■■■■■ 28.1
FMR1Q06787 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.462e-13■■■■■ 28.1
FMR1Q06787 RNF213-213ENST00000571908 624 ntTSL 28.93□□□□□ -0.981e-6■■■■■ 28.1
FMR1Q06787 EIF4G1-230ENST00000460829 1804 ntTSL 222.39■■□□□ 1.178e-10■■■■■ 28.1
FMR1Q06787 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.229e-7■■■■■ 28.1
FMR1Q06787 URB2-201ENST00000258243 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.582e-6■■■■■ 28.1
FMR1Q06787 JUP-205ENST00000424457 949 ntTSL 319.5■□□□□ 0.715e-8■■■■■ 28
FMR1Q06787 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.022e-6■■■■■ 28
FMR1Q06787 DNMT1-206ENST00000586086 489 ntTSL 310.26□□□□□ -0.778e-7■■■■■ 28
FMR1Q06787 PPP2R2D-207ENST00000616467 2058 ntTSL 1 (best)29.27■■■□□ 2.286e-21■■■■■ 27.9
FMR1Q06787 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.386e-21■■■■■ 27.9
FMR1Q06787 PPP2R2D-204ENST00000482010 1792 ntTSL 221.87■■□□□ 1.096e-21■■■■■ 27.9
FMR1Q06787 PPP2R2D-205ENST00000490777 1462 ntTSL 1 (best)21■□□□□ 0.956e-21■■■■■ 27.9
FMR1Q06787 PPP2R2D-203ENST00000472664 770 ntTSL 317.95■□□□□ 0.466e-21■■■■■ 27.9
FMR1Q06787 PPP2R2D-202ENST00000470416 6203 ntTSL 1 (best)11.06□□□□□ -0.646e-21■■■■■ 27.9
FMR1Q06787 PPP2R2D-206ENST00000517472 573 ntTSL 35.04□□□□□ -1.66e-21■■■■■ 27.9
FMR1Q06787 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.23e-9■■■■■ 27.9
FMR1Q06787 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.042e-6■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 MOB1B-205ENST00000511449 627 ntTSL 321.57■■□□□ 1.042e-6■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.382e-6■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 UQCRC1-210ENST00000493806 567 ntTSL 420.81■□□□□ 0.929e-20■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 SPTB-208ENST00000556626 10153 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.69e-7■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 ZMYM2-202ENST00000382871 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.926e-12■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.246e-12■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.946e-12■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 SPTB-202ENST00000389720 6321 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.379e-7■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 VARS-224ENST00000479051 612 ntTSL 325.02■■□□□ 1.62e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 IGF2BP3-213ENST00000491719 800 ntTSL 527.35■■□□□ 1.978e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.388e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.198e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.161e-9■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 FOXK2-202ENST00000473637 3462 ntTSL 1 (best)22.27■■□□□ 1.161e-9■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 DYM-204ENST00000577481 567 ntTSL 522.19■■□□□ 1.148e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 DYM-209ENST00000579058 869 ntTSL 321.56■■□□□ 1.048e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.038e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.968e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 IGF2BP3-207ENST00000468263 706 ntTSL 220.59■□□□□ 0.898e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 GPR89B-203ENST00000468618 750 ntTSL 320.56■□□□□ 0.888e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 BLCAP-213ENST00000467603 439 ntTSL 320.49■□□□□ 0.878e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 GPR89B-205ENST00000488165 1954 ntTSL 1 (best)19.12■□□□□ 0.658e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 IGF2BP3-203ENST00000465058 534 ntTSL 418.91■□□□□ 0.628e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 IGF2BP3-211ENST00000479504 559 ntTSL 418.91■□□□□ 0.628e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.615e-7■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 PARD6G-AS1-203ENST00000587254 584 ntTSL 418.77■□□□□ 0.68e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 PARD6G-AS1-201ENST00000585422 525 ntTSL 418.77■□□□□ 0.68e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 MYBBP1A-208ENST00000573175 898 ntTSL 318.52■□□□□ 0.566e-7■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.528e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.488e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 GPR89B-204ENST00000478307 2633 ntTSL 217.65■□□□□ 0.428e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 IGF2BP3-204ENST00000466809 588 ntTSL 517.58■□□□□ 0.48e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 UQCC1-213ENST00000453855 1035 ntTSL 417.56■□□□□ 0.48e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.398e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.368e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 IGF2BP2-205ENST00000461957 509 ntTSL 516.85■□□□□ 0.298e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.298e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.248e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 TRRAP-206ENST00000480695 805 ntTSL 416.22■□□□□ 0.198e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.165e-7■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.158e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 IGF2BP2-208ENST00000466476 469 ntTSL 215.93■□□□□ 0.148e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 UQCC1-210ENST00000424405 758 ntTSL 515.76■□□□□ 0.118e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.078e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 ZNF106-212ENST00000570078 633 ntTSL 315.4■□□□□ 0.068e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 XPO6-222ENST00000573645 509 ntTSL 315.29■□□□□ 0.042e-7■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 IGF2BP2-203ENST00000421047 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.028e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 UQCC1-209ENST00000397556 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.038e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 IGF2BP2-204ENST00000457616 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.058e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 IGF2BP3-214ENST00000492771 564 ntTSL 414.54□□□□□ -0.088e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 DHX29-202ENST00000504778 4557 ntTSL 1 (best)14.53□□□□□ -0.081e-7■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.128e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 UQCC1-214ENST00000457259 1987 ntTSL 1 (best)14.11□□□□□ -0.158e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 IGF2BP2-201ENST00000346192 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.158e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 ZNF106-211ENST00000569648 788 ntTSL 313.99□□□□□ -0.178e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 UQCC1-206ENST00000374394 2329 ntTSL 213.96□□□□□ -0.178e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 C8orf44-203ENST00000519561 1835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.198e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 NUDT5-209ENST00000537776 1201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.218e-8■■■■■ 27.8
Retrieved 100 of 13,491 protein–RNA pairs in 60.3 ms