Protein–RNA interactions for Protein: Q05CL8

Larp7, La-related protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp7Q05CL8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Larp7Q05CL8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Larp7Q05CL8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Larp7Q05CL8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Larp7Q05CL8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Larp7Q05CL8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Larp7Q05CL8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Larp7Q05CL8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Larp7Q05CL8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Larp7Q05CL8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Larp7Q05CL8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Larp7Q05CL8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Larp7Q05CL8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Larp7Q05CL8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Larp7Q05CL8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Larp7Q05CL8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Larp7Q05CL8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Larp7Q05CL8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Larp7Q05CL8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Larp7Q05CL8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Larp7Q05CL8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Larp7Q05CL8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Larp7Q05CL8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Larp7Q05CL8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Larp7Q05CL8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Larp7Q05CL8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Larp7Q05CL8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Larp7Q05CL8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Larp7Q05CL8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Larp7Q05CL8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Larp7Q05CL8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Larp7Q05CL8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Larp7Q05CL8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Larp7Q05CL8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Larp7Q05CL8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Larp7Q05CL8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Larp7Q05CL8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Larp7Q05CL8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Larp7Q05CL8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Larp7Q05CL8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Larp7Q05CL8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Larp7Q05CL8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Larp7Q05CL8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Larp7Q05CL8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Larp7Q05CL8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Larp7Q05CL8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Larp7Q05CL8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Larp7Q05CL8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Larp7Q05CL8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Larp7Q05CL8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Larp7Q05CL8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms