Protein–RNA interactions for Protein: Q04116

YHP1, Homeobox protein YHP1, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHP1Q04116 YJR012CYJR012C 624 nt3.75□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 ECM15YBL001C 315 nt3.75□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 ARG8YOL140W 1272 nt3.75□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 YBR016WYBR016W 387 nt3.75□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 RPL43BYJR094W-A 279 nt3.74□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 CDC21YOR074C 915 nt3.74□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 KGD1YIL125W 3045 nt3.74□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 VHC1YBR235W 3363 nt3.74□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 ZPR1YGR211W 1461 nt3.73□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 PAH1YMR165C 2589 nt3.73□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 HPC2YBR215W 1878 nt3.73□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 PRD1YCL057W 2139 nt3.73□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 YDR545C-AYDR545C-A 480 nt3.73□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 YEL053W-AYEL053W-A 348 nt3.73□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 YEL077W-AYEL077W-A 483 nt3.73□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 YER190C-BYER190C-B 483 nt3.73□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 YFL068WYFL068W 483 nt3.73□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 YGR296C-BYGR296C-B 483 nt3.73□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 YHL050W-AYHL050W-A 483 nt3.73□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 YHR193C-AYHR193C-A 375 nt3.73□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 YHR219C-AYHR219C-A 483 nt3.73□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 YIL177W-AYIL177W-A 483 nt3.73□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 YJL225W-AYJL225W-A 483 nt3.73□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 YLL066W-AYLL066W-A 483 nt3.73□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 YLL067W-AYLL067W-A 483 nt3.73□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 YLR466C-AYLR466C-A 483 nt3.73□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 YLR467C-AYLR467C-A 483 nt3.73□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 YML133W-BYML133W-B 483 nt3.73□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 YNL339W-BYNL339W-B 483 nt3.73□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 YBL113W-AYBL113W-A 483 nt3.73□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 YOR396C-AYOR396C-A 483 nt3.73□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 YPL283W-BYPL283W-B 483 nt3.73□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 YPR169W-AYPR169W-A 219 nt3.73□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 YPR170W-BYPR170W-B 258 nt3.73□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 YPR204C-AYPR204C-A 483 nt3.73□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 YCL021W-AYCL021W-A 378 nt3.73□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 MDR1YGR100W 2853 nt3.73□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 YER158CYER158C 1722 nt3.73□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 BUD7YOR299W 2241 nt3.72□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 MEC3YLR288C 1425 nt3.72□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 APE1YKL103C 1545 nt3.72□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 RIP1YEL024W 648 nt3.72□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 YAL047W-AYAL047W-A 330 nt3.72□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 CSR1YLR380W 1227 nt3.72□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 MRPL39YML009C 213 nt3.72□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 YMR105W-AYMR105W-A 195 nt3.72□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 YLH47YPR125W 1365 nt3.72□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 CPS1YJL172W 1731 nt3.72□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 STP4YDL048C 1473 nt3.72□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 AKL1YBR059C 3327 nt3.72□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 PCA1YBR295W 3651 nt3.72□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 EAR1YMR171C 1653 nt3.71□□□□□ -1.81
YHP1Q04116 MBP1YDL056W 2502 nt3.71□□□□□ -1.82
YHP1Q04116 AIM10YER087W 1731 nt3.71□□□□□ -1.82
YHP1Q04116 YJL215CYJL215C 360 nt3.71□□□□□ -1.82
YHP1Q04116 GIP1YBR045C 1920 nt3.71□□□□□ -1.82
YHP1Q04116 ATH1YPR026W 3636 nt3.71□□□□□ -1.82
YHP1Q04116 YDL027CYDL027C 1263 nt3.7□□□□□ -1.82
YHP1Q04116 RSM10YDR041W 612 nt3.7□□□□□ -1.82
YHP1Q04116 SKI6YGR195W 741 nt3.7□□□□□ -1.82
YHP1Q04116 GPP1YIL053W 753 nt3.7□□□□□ -1.82
YHP1Q04116 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt3.7□□□□□ -1.82
YHP1Q04116 APS1YLR170C 471 nt3.7□□□□□ -1.82
YHP1Q04116 FBP1YLR377C 1047 nt3.7□□□□□ -1.82
YHP1Q04116 URA7YBL039C 1740 nt3.7□□□□□ -1.82
YHP1Q04116 tK(CUU)CtK(CUU)C 73 nt3.69□□□□□ -1.82
YHP1Q04116 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt3.69□□□□□ -1.82
YHP1Q04116 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt3.69□□□□□ -1.82
YHP1Q04116 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt3.69□□□□□ -1.82
YHP1Q04116 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt3.69□□□□□ -1.82
YHP1Q04116 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt3.69□□□□□ -1.82
YHP1Q04116 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt3.69□□□□□ -1.82
YHP1Q04116 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt3.69□□□□□ -1.82
YHP1Q04116 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt3.69□□□□□ -1.82
YHP1Q04116 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt3.69□□□□□ -1.82
YHP1Q04116 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt3.69□□□□□ -1.82
YHP1Q04116 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt3.69□□□□□ -1.82
YHP1Q04116 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt3.69□□□□□ -1.82
YHP1Q04116 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt3.69□□□□□ -1.82
YHP1Q04116 TVP38YKR088C 1014 nt3.69□□□□□ -1.82
YHP1Q04116 SAP30YMR263W 606 nt3.69□□□□□ -1.82
YHP1Q04116 BUD17YNR027W 954 nt3.69□□□□□ -1.82
YHP1Q04116 MGR2YPL098C 342 nt3.69□□□□□ -1.82
YHP1Q04116 LAS21YJL062W 2493 nt3.69□□□□□ -1.82
YHP1Q04116 MCM4YPR019W 2802 nt3.69□□□□□ -1.82
YHP1Q04116 PRM1YNL279W 1986 nt3.69□□□□□ -1.82
YHP1Q04116 KRS1YDR037W 1776 nt3.68□□□□□ -1.82
YHP1Q04116 IMA3YIL172C 1770 nt3.68□□□□□ -1.82
YHP1Q04116 IMA4YJL221C 1770 nt3.68□□□□□ -1.82
YHP1Q04116 YTA12YMR089C 2478 nt3.68□□□□□ -1.82
YHP1Q04116 ARG82YDR173C 1068 nt3.68□□□□□ -1.82
YHP1Q04116 SNA2YDR525W-A 240 nt3.68□□□□□ -1.82
YHP1Q04116 YGR066CYGR066C 879 nt3.68□□□□□ -1.82
YHP1Q04116 LSO1YJR005C-A 282 nt3.68□□□□□ -1.82
YHP1Q04116 YPL191CYPL191C 1083 nt3.68□□□□□ -1.82
YHP1Q04116 LYS2YBR115C 4179 nt3.68□□□□□ -1.82
YHP1Q04116 SWC3YAL011W 1878 nt3.68□□□□□ -1.82
YHP1Q04116 HSP82YPL240C 2130 nt3.68□□□□□ -1.82
YHP1Q04116 ISR1YPR106W 1332 nt3.68□□□□□ -1.82
YHP1Q04116 NUP2YLR335W 2163 nt3.68□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 42.4 ms