Protein–RNA interactions for Protein: P61202

Cops2, COP9 signalosome complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops2P61202 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cops2P61202 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cops2P61202 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cops2P61202 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cops2P61202 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cops2P61202 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cops2P61202 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Cops2P61202 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cops2P61202 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cops2P61202 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cops2P61202 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cops2P61202 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cops2P61202 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cops2P61202 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cops2P61202 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cops2P61202 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cops2P61202 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cops2P61202 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cops2P61202 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cops2P61202 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cops2P61202 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cops2P61202 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cops2P61202 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cops2P61202 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cops2P61202 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cops2P61202 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cops2P61202 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cops2P61202 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cops2P61202 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cops2P61202 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cops2P61202 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cops2P61202 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cops2P61202 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cops2P61202 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cops2P61202 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cops2P61202 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cops2P61202 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cops2P61202 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cops2P61202 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cops2P61202 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cops2P61202 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cops2P61202 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cops2P61202 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cops2P61202 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cops2P61202 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cops2P61202 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cops2P61202 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cops2P61202 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cops2P61202 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cops2P61202 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cops2P61202 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cops2P61202 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cops2P61202 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cops2P61202 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cops2P61202 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cops2P61202 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cops2P61202 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cops2P61202 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cops2P61202 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cops2P61202 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cops2P61202 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cops2P61202 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cops2P61202 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cops2P61202 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cops2P61202 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cops2P61202 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cops2P61202 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cops2P61202 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cops2P61202 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cops2P61202 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cops2P61202 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cops2P61202 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cops2P61202 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cops2P61202 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cops2P61202 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cops2P61202 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cops2P61202 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cops2P61202 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cops2P61202 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cops2P61202 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cops2P61202 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cops2P61202 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cops2P61202 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cops2P61202 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cops2P61202 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cops2P61202 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cops2P61202 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cops2P61202 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cops2P61202 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cops2P61202 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cops2P61202 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cops2P61202 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cops2P61202 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cops2P61202 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cops2P61202 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cops2P61202 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cops2P61202 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cops2P61202 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cops2P61202 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cops2P61202 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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