Protein–RNA interactions for Protein: P50993

ATP1A2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A2P50993 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP1A2P50993 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP1A2P50993 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP1A2P50993 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP1A2P50993 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP1A2P50993 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP1A2P50993 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP1A2P50993 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP1A2P50993 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP1A2P50993 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP1A2P50993 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP1A2P50993 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP1A2P50993 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP1A2P50993 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP1A2P50993 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP1A2P50993 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP1A2P50993 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP1A2P50993 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP1A2P50993 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP1A2P50993 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP1A2P50993 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP1A2P50993 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP1A2P50993 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP1A2P50993 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP1A2P50993 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP1A2P50993 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP1A2P50993 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP1A2P50993 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP1A2P50993 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATP1A2P50993 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms