Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERFP50548 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERFP50548 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERFP50548 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERFP50548 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERFP50548 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERFP50548 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERFP50548 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERFP50548 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERFP50548 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ERFP50548 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ERFP50548 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ERFP50548 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ERFP50548 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERFP50548 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERFP50548 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERFP50548 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERFP50548 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ERFP50548 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERFP50548 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERFP50548 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERFP50548 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERFP50548 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERFP50548 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERFP50548 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERFP50548 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERFP50548 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERFP50548 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERFP50548 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERFP50548 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERFP50548 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERFP50548 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERFP50548 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERFP50548 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERFP50548 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ERFP50548 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ERFP50548 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ERFP50548 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ERFP50548 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ERFP50548 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ERFP50548 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ERFP50548 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ERFP50548 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ERFP50548 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERFP50548 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERFP50548 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERFP50548 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERFP50548 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERFP50548 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERFP50548 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERFP50548 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERFP50548 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ERFP50548 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERFP50548 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERFP50548 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERFP50548 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ERFP50548 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERFP50548 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERFP50548 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERFP50548 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERFP50548 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERFP50548 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERFP50548 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERFP50548 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERFP50548 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERFP50548 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERFP50548 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERFP50548 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERFP50548 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERFP50548 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ERFP50548 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ERFP50548 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ERFP50548 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERFP50548 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERFP50548 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERFP50548 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERFP50548 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERFP50548 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERFP50548 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERFP50548 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ERFP50548 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ERFP50548 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERFP50548 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERFP50548 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERFP50548 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERFP50548 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERFP50548 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERFP50548 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ERFP50548 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ERFP50548 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ERFP50548 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ERFP50548 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ERFP50548 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ERFP50548 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERFP50548 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERFP50548 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERFP50548 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERFP50548 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERFP50548 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERFP50548 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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