Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 TSL1YML100W 3297 nt4.49□□□□□ -1.69
DDI1P40087 FAA4YMR246W 2085 nt4.49□□□□□ -1.69
DDI1P40087 EUG1YDR518W 1554 nt4.48□□□□□ -1.69
DDI1P40087 YGR035W-AYGR035W-A 222 nt4.48□□□□□ -1.69
DDI1P40087 YGR153WYGR153W 654 nt4.48□□□□□ -1.69
DDI1P40087 POM33YLL023C 840 nt4.48□□□□□ -1.69
DDI1P40087 TOM40YMR203W 1164 nt4.48□□□□□ -1.69
DDI1P40087 HEM15YOR176W 1182 nt4.48□□□□□ -1.69
DDI1P40087 SSB1YDL229W 1842 nt4.48□□□□□ -1.69
DDI1P40087 SSB2YNL209W 1842 nt4.48□□□□□ -1.69
DDI1P40087 FZO1YBR179C 2568 nt4.48□□□□□ -1.69
DDI1P40087 RHB1YCR027C 630 nt4.47□□□□□ -1.69
DDI1P40087 tK(CUU)CtK(CUU)C 73 nt4.47□□□□□ -1.69
DDI1P40087 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt4.47□□□□□ -1.69
DDI1P40087 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt4.47□□□□□ -1.69
DDI1P40087 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt4.47□□□□□ -1.69
DDI1P40087 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt4.47□□□□□ -1.69
DDI1P40087 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt4.47□□□□□ -1.69
DDI1P40087 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt4.47□□□□□ -1.69
DDI1P40087 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt4.47□□□□□ -1.69
DDI1P40087 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt4.47□□□□□ -1.69
DDI1P40087 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt4.47□□□□□ -1.69
DDI1P40087 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt4.47□□□□□ -1.69
DDI1P40087 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt4.47□□□□□ -1.69
DDI1P40087 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt4.47□□□□□ -1.69
DDI1P40087 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt4.47□□□□□ -1.69
DDI1P40087 COS6YGR295C 1146 nt4.47□□□□□ -1.69
DDI1P40087 NSG1YHR133C 876 nt4.47□□□□□ -1.69
DDI1P40087 YML057C-AYML057C-A 390 nt4.47□□□□□ -1.69
DDI1P40087 YIM1YMR152W 1098 nt4.47□□□□□ -1.69
DDI1P40087 MDM34YGL219C 1380 nt4.47□□□□□ -1.69
DDI1P40087 CDS1YBR029C 1374 nt4.47□□□□□ -1.69
DDI1P40087 UGA2YBR006W 1494 nt4.47□□□□□ -1.69
DDI1P40087 MMT2YPL224C 1455 nt4.47□□□□□ -1.69
DDI1P40087 EGT2YNL327W 3126 nt4.47□□□□□ -1.69
DDI1P40087 HRK1YOR267C 2280 nt4.47□□□□□ -1.69
DDI1P40087 FRE1YLR214W 2061 nt4.46□□□□□ -1.7
DDI1P40087 CBP1YJL209W 1965 nt4.46□□□□□ -1.7
DDI1P40087 SAC1YKL212W 1872 nt4.46□□□□□ -1.7
DDI1P40087 KRS1YDR037W 1776 nt4.46□□□□□ -1.7
DDI1P40087 SCM3YDL139C 672 nt4.46□□□□□ -1.7
DDI1P40087 SSP120YLR250W 705 nt4.46□□□□□ -1.7
DDI1P40087 YOR292CYOR292C 930 nt4.46□□□□□ -1.7
DDI1P40087 YMR196WYMR196W 3267 nt4.45□□□□□ -1.7
DDI1P40087 SAP155YFR040W 3009 nt4.45□□□□□ -1.7
DDI1P40087 CLB4YLR210W 1383 nt4.45□□□□□ -1.7
DDI1P40087 YIL028WYIL028W 399 nt4.45□□□□□ -1.7
DDI1P40087 GTR1YML121W 933 nt4.45□□□□□ -1.7
DDI1P40087 TRM10YOL093W 882 nt4.45□□□□□ -1.7
DDI1P40087 IML2YJL082W 2196 nt4.44□□□□□ -1.7
DDI1P40087 RVB1YDR190C 1392 nt4.44□□□□□ -1.7
DDI1P40087 SLD2YKL108W 1362 nt4.44□□□□□ -1.7
DDI1P40087 YCR006CYCR006C 474 nt4.44□□□□□ -1.7
DDI1P40087 RIP1YEL024W 648 nt4.44□□□□□ -1.7
DDI1P40087 YHL034W-AYHL034W-A 462 nt4.44□□□□□ -1.7
DDI1P40087 YJL215CYJL215C 360 nt4.44□□□□□ -1.7
DDI1P40087 PAU17YLL025W 375 nt4.44□□□□□ -1.7
DDI1P40087 SUM1YDR310C 3189 nt4.43□□□□□ -1.7
DDI1P40087 FPK1YNR047W 2682 nt4.43□□□□□ -1.7
DDI1P40087 AIR2YDL175C 1035 nt4.43□□□□□ -1.7
DDI1P40087 YKR104WYKR104W 921 nt4.43□□□□□ -1.7
DDI1P40087 PML1YLR016C 615 nt4.43□□□□□ -1.7
DDI1P40087 RPC19YNL113W 429 nt4.43□□□□□ -1.7
DDI1P40087 MDM12YOL009C 816 nt4.43□□□□□ -1.7
DDI1P40087 YPR109WYPR109W 885 nt4.43□□□□□ -1.7
DDI1P40087 SKG6YHR149C 2205 nt4.42□□□□□ -1.7
DDI1P40087 HNT2YDR305C 654 nt4.42□□□□□ -1.7
DDI1P40087 BCP1YDR361C 852 nt4.42□□□□□ -1.7
DDI1P40087 PDR15YDR406W 4590 nt4.42□□□□□ -1.7
DDI1P40087 DAM1YGR113W 1032 nt4.42□□□□□ -1.7
DDI1P40087 BUD17YNR027W 954 nt4.42□□□□□ -1.7
DDI1P40087 SSA2YLL024C 1920 nt4.42□□□□□ -1.7
DDI1P40087 HXT4YHR092C 1731 nt4.41□□□□□ -1.7
DDI1P40087 ADY2YCR010C 852 nt4.41□□□□□ -1.7
DDI1P40087 OSW5YMR148W 447 nt4.41□□□□□ -1.7
DDI1P40087 MDG1YNL173C 1101 nt4.41□□□□□ -1.7
DDI1P40087 ELA1YNL230C 1140 nt4.41□□□□□ -1.7
DDI1P40087 KIC1YHR102W 3243 nt4.41□□□□□ -1.7
DDI1P40087 MNN1YER001W 2289 nt4.41□□□□□ -1.7
DDI1P40087 NUP2YLR335W 2163 nt4.4□□□□□ -1.7
DDI1P40087 ARP2YDL029W 1176 nt4.4□□□□□ -1.71
DDI1P40087 RPL43BYJR094W-A 279 nt4.4□□□□□ -1.71
DDI1P40087 RRT7YLL030C 342 nt4.4□□□□□ -1.71
DDI1P40087 TAF5YBR198C 2397 nt4.4□□□□□ -1.71
DDI1P40087 THS1YIL078W 2205 nt4.4□□□□□ -1.71
DDI1P40087 CDC15YAR019C 2925 nt4.39□□□□□ -1.71
DDI1P40087 TIM54YJL054W 1437 nt4.39□□□□□ -1.71
DDI1P40087 THI21YPL258C 1656 nt4.39□□□□□ -1.71
DDI1P40087 YOL153CYOL153C 1746 nt4.39□□□□□ -1.71
DDI1P40087 ARP10YDR106W 855 nt4.39□□□□□ -1.71
DDI1P40087 SLO1YER180C-A 258 nt4.39□□□□□ -1.71
DDI1P40087 SUT1YGL162W 900 nt4.39□□□□□ -1.71
DDI1P40087 NTR2YKR022C 969 nt4.39□□□□□ -1.71
DDI1P40087 YNL174WYNL174W 573 nt4.39□□□□□ -1.71
DDI1P40087 ARC40YBR234C 1155 nt4.39□□□□□ -1.71
DDI1P40087 PHO84YML123C 1764 nt4.38□□□□□ -1.71
DDI1P40087 RRN11YML043C 1524 nt4.38□□□□□ -1.71
DDI1P40087 YDR545C-AYDR545C-A 480 nt4.38□□□□□ -1.71
DDI1P40087 YEL077W-AYEL077W-A 483 nt4.38□□□□□ -1.71
DDI1P40087 YER190C-BYER190C-B 483 nt4.38□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.7 ms