Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TGFBR1P36897 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TGFBR1P36897 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TGFBR1P36897 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms