Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SFTPDP35247 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFTPDP35247 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFTPDP35247 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFTPDP35247 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFTPDP35247 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFTPDP35247 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFTPDP35247 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SFTPDP35247 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFTPDP35247 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFTPDP35247 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFTPDP35247 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFTPDP35247 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SFTPDP35247 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFTPDP35247 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFTPDP35247 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFTPDP35247 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SFTPDP35247 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SFTPDP35247 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SFTPDP35247 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SFTPDP35247 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SFTPDP35247 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SFTPDP35247 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SFTPDP35247 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SFTPDP35247 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SFTPDP35247 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFTPDP35247 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFTPDP35247 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFTPDP35247 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFTPDP35247 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFTPDP35247 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms