Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTPS1P17812 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTPS1P17812 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTPS1P17812 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTPS1P17812 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTPS1P17812 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTPS1P17812 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTPS1P17812 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTPS1P17812 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTPS1P17812 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTPS1P17812 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTPS1P17812 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTPS1P17812 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTPS1P17812 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTPS1P17812 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTPS1P17812 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTPS1P17812 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTPS1P17812 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CTPS1P17812 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTPS1P17812 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTPS1P17812 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTPS1P17812 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTPS1P17812 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTPS1P17812 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTPS1P17812 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTPS1P17812 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTPS1P17812 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTPS1P17812 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTPS1P17812 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTPS1P17812 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTPS1P17812 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTPS1P17812 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTPS1P17812 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTPS1P17812 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTPS1P17812 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTPS1P17812 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTPS1P17812 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTPS1P17812 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTPS1P17812 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTPS1P17812 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTPS1P17812 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTPS1P17812 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTPS1P17812 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTPS1P17812 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTPS1P17812 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTPS1P17812 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTPS1P17812 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTPS1P17812 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTPS1P17812 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTPS1P17812 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTPS1P17812 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTPS1P17812 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTPS1P17812 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTPS1P17812 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTPS1P17812 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CTPS1P17812 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTPS1P17812 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms