Protein–RNA interactions for Protein: P11233

RALA, Ras-related protein Ral-A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALAP11233 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RALAP11233 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RALAP11233 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RALAP11233 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RALAP11233 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RALAP11233 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RALAP11233 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RALAP11233 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RALAP11233 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RALAP11233 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RALAP11233 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RALAP11233 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RALAP11233 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RALAP11233 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RALAP11233 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RALAP11233 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RALAP11233 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RALAP11233 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RALAP11233 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RALAP11233 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RALAP11233 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RALAP11233 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RALAP11233 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RALAP11233 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RALAP11233 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RALAP11233 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RALAP11233 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RALAP11233 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RALAP11233 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RALAP11233 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RALAP11233 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RALAP11233 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RALAP11233 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RALAP11233 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RALAP11233 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RALAP11233 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RALAP11233 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RALAP11233 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RALAP11233 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RALAP11233 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RALAP11233 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RALAP11233 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RALAP11233 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RALAP11233 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RALAP11233 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RALAP11233 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RALAP11233 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RALAP11233 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RALAP11233 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RALAP11233 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RALAP11233 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RALAP11233 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RALAP11233 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RALAP11233 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RALAP11233 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RALAP11233 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RALAP11233 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RALAP11233 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RALAP11233 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RALAP11233 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RALAP11233 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RALAP11233 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RALAP11233 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RALAP11233 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RALAP11233 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RALAP11233 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RALAP11233 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RALAP11233 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RALAP11233 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RALAP11233 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RALAP11233 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RALAP11233 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RALAP11233 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RALAP11233 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RALAP11233 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RALAP11233 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RALAP11233 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RALAP11233 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RALAP11233 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RALAP11233 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RALAP11233 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RALAP11233 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RALAP11233 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RALAP11233 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RALAP11233 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RALAP11233 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RALAP11233 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RALAP11233 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RALAP11233 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RALAP11233 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RALAP11233 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RALAP11233 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RALAP11233 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RALAP11233 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RALAP11233 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RALAP11233 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RALAP11233 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RALAP11233 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RALAP11233 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RALAP11233 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms