Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Tnp1P10856 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Tnp1P10856 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms