Protein–RNA interactions for Protein: P0DJR0

GIMD1, GTPase IMAP family member GIMD1, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIMD1P0DJR0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GIMD1P0DJR0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GIMD1P0DJR0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GIMD1P0DJR0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GIMD1P0DJR0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GIMD1P0DJR0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GIMD1P0DJR0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GIMD1P0DJR0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GIMD1P0DJR0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GIMD1P0DJR0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GIMD1P0DJR0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GIMD1P0DJR0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GIMD1P0DJR0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GIMD1P0DJR0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GIMD1P0DJR0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GIMD1P0DJR0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GIMD1P0DJR0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GIMD1P0DJR0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GIMD1P0DJR0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GIMD1P0DJR0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GIMD1P0DJR0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GIMD1P0DJR0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GIMD1P0DJR0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GIMD1P0DJR0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GIMD1P0DJR0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GIMD1P0DJR0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GIMD1P0DJR0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GIMD1P0DJR0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GIMD1P0DJR0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GIMD1P0DJR0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GIMD1P0DJR0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GIMD1P0DJR0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GIMD1P0DJR0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GIMD1P0DJR0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GIMD1P0DJR0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GIMD1P0DJR0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GIMD1P0DJR0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GIMD1P0DJR0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GIMD1P0DJR0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GIMD1P0DJR0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GIMD1P0DJR0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GIMD1P0DJR0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GIMD1P0DJR0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GIMD1P0DJR0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GIMD1P0DJR0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GIMD1P0DJR0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GIMD1P0DJR0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GIMD1P0DJR0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GIMD1P0DJR0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GIMD1P0DJR0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GIMD1P0DJR0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIMD1P0DJR0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms