Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TtrP07309 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TtrP07309 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TtrP07309 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TtrP07309 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TtrP07309 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TtrP07309 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TtrP07309 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TtrP07309 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TtrP07309 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TtrP07309 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TtrP07309 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TtrP07309 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TtrP07309 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TtrP07309 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TtrP07309 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TtrP07309 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TtrP07309 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TtrP07309 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TtrP07309 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TtrP07309 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TtrP07309 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TtrP07309 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TtrP07309 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TtrP07309 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TtrP07309 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TtrP07309 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TtrP07309 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TtrP07309 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TtrP07309 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TtrP07309 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TtrP07309 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TtrP07309 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TtrP07309 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TtrP07309 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TtrP07309 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TtrP07309 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TtrP07309 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TtrP07309 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TtrP07309 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TtrP07309 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TtrP07309 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TtrP07309 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TtrP07309 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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TtrP07309 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TtrP07309 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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TtrP07309 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TtrP07309 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TtrP07309 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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TtrP07309 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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TtrP07309 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TtrP07309 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TtrP07309 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TtrP07309 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TtrP07309 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TtrP07309 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TtrP07309 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TtrP07309 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TtrP07309 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TtrP07309 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TtrP07309 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TtrP07309 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TtrP07309 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TtrP07309 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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TtrP07309 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TtrP07309 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TtrP07309 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TtrP07309 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TtrP07309 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TtrP07309 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TtrP07309 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TtrP07309 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TtrP07309 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TtrP07309 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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