Protein–RNA interactions for Protein: P01728

Ig lambda-2 chain V region, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01728 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01728 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01728 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01728 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01728 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01728 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01728 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01728 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01728 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01728 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01728 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01728 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01728 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01728 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01728 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01728 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01728 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01728 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01728 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01728 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01728 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01728 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01728 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01728 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01728 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01728 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01728 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01728 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01728 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01728 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01728 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01728 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01728 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01728 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01728 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01728 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01728 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01728 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01728 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01728 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01728 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01728 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01728 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01728 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01728 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01728 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01728 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01728 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01728 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01728 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01728 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01728 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01728 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01728 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01728 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01728 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01728 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01728 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01728 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01728 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01728 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01728 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01728 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01728 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01728 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01728 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01728 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01728 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01728 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01728 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01728 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01728 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01728 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01728 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01728 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01728 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01728 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01728 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01728 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01728 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01728 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01728 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01728 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01728 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01728 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01728 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01728 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01728 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01728 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01728 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01728 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01728 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01728 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01728 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01728 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01728 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01728 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01728 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01728 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01728 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms