Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp2a2O55143 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp2a2O55143 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp2a2O55143 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp2a2O55143 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp2a2O55143 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp2a2O55143 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp2a2O55143 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp2a2O55143 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp2a2O55143 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp2a2O55143 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp2a2O55143 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp2a2O55143 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp2a2O55143 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp2a2O55143 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp2a2O55143 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Atp2a2O55143 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Atp2a2O55143 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp2a2O55143 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp2a2O55143 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp2a2O55143 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp2a2O55143 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp2a2O55143 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp2a2O55143 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp2a2O55143 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp2a2O55143 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp2a2O55143 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp2a2O55143 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp2a2O55143 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp2a2O55143 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp2a2O55143 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp2a2O55143 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp2a2O55143 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp2a2O55143 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp2a2O55143 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp2a2O55143 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp2a2O55143 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp2a2O55143 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp2a2O55143 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp2a2O55143 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp2a2O55143 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp2a2O55143 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp2a2O55143 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp2a2O55143 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp2a2O55143 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp2a2O55143 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp2a2O55143 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp2a2O55143 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp2a2O55143 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp2a2O55143 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp2a2O55143 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp2a2O55143 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp2a2O55143 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp2a2O55143 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp2a2O55143 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp2a2O55143 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Atp2a2O55143 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp2a2O55143 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp2a2O55143 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp2a2O55143 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp2a2O55143 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp2a2O55143 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp2a2O55143 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp2a2O55143 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp2a2O55143 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp2a2O55143 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp2a2O55143 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp2a2O55143 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp2a2O55143 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp2a2O55143 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp2a2O55143 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp2a2O55143 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp2a2O55143 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp2a2O55143 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp2a2O55143 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp2a2O55143 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp2a2O55143 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp2a2O55143 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp2a2O55143 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp2a2O55143 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp2a2O55143 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp2a2O55143 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp2a2O55143 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp2a2O55143 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp2a2O55143 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp2a2O55143 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp2a2O55143 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp2a2O55143 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp2a2O55143 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp2a2O55143 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp2a2O55143 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp2a2O55143 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp2a2O55143 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp2a2O55143 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp2a2O55143 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp2a2O55143 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp2a2O55143 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp2a2O55143 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp2a2O55143 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp2a2O55143 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms