Protein–RNA interactions for Protein: A5YKK6

CNOT1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT1A5YKK6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CNOT1A5YKK6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms