Protein–RNA interactions for Protein: A0A5B9

TRBC2, T-cell receptor beta-2 chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBC2A0A5B9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRBC2A0A5B9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRBC2A0A5B9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRBC2A0A5B9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRBC2A0A5B9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRBC2A0A5B9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRBC2A0A5B9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRBC2A0A5B9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRBC2A0A5B9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRBC2A0A5B9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRBC2A0A5B9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRBC2A0A5B9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRBC2A0A5B9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRBC2A0A5B9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRBC2A0A5B9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRBC2A0A5B9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRBC2A0A5B9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRBC2A0A5B9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRBC2A0A5B9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRBC2A0A5B9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRBC2A0A5B9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRBC2A0A5B9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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