Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYTH1Q15438 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms