Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DSC2Q02487 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DSC2Q02487 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DSC2Q02487 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DSC2Q02487 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DSC2Q02487 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DSC2Q02487 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DSC2Q02487 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DSC2Q02487 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DSC2Q02487 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DSC2Q02487 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DSC2Q02487 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DSC2Q02487 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DSC2Q02487 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DSC2Q02487 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DSC2Q02487 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DSC2Q02487 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DSC2Q02487 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DSC2Q02487 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DSC2Q02487 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DSC2Q02487 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DSC2Q02487 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DSC2Q02487 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DSC2Q02487 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DSC2Q02487 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DSC2Q02487 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DSC2Q02487 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DSC2Q02487 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DSC2Q02487 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DSC2Q02487 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DSC2Q02487 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DSC2Q02487 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
DSC2Q02487 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DSC2Q02487 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DSC2Q02487 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DSC2Q02487 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
DSC2Q02487 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
DSC2Q02487 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DSC2Q02487 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DSC2Q02487 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DSC2Q02487 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DSC2Q02487 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DSC2Q02487 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms