Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SgcdP82347 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SgcdP82347 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SgcdP82347 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SgcdP82347 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SgcdP82347 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SgcdP82347 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Lrtm1-203ENSMUST00000224760 3060 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SgcdP82347 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SgcdP82347 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SgcdP82347 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SgcdP82347 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SgcdP82347 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SgcdP82347 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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