Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FGFR3P22607 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms