Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACTN1P12814 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACTN1P12814 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms