Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 SLC25A35-203ENST00000579192 2136 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 PLA1A-206ENST00000495992 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 PERM1-202ENST00000433179 3340 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 CASS4-202ENST00000434344 2888 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 CSF3R-201ENST00000331941 2375 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 EGFLAM-204ENST00000397202 2398 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 FN1-201ENST00000323926 8708 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms