Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.8 ms