Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEUP1Q05D60 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEUP1Q05D60 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms