Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LHX3Q9UBR4 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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LHX3Q9UBR4 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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LHX3Q9UBR4 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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