Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
NICN1Q9BSH3 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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