Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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