Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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